Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RNF5Q99942 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF5Q99942 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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