Protein–RNA interactions for Protein: Q99603

TRGV9, T-cell receptor gamma variable 9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV9Q99603 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV9Q99603 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms