Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms