Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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