Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAM1Q96QH2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAM1Q96QH2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms