Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf85Q96MD7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms