Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms