Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms