Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms