Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms