Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms