Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM18Q96B42 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM18Q96B42 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM18Q96B42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM18Q96B42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM18Q96B42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM18Q96B42 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms