Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1AQ96AJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms