Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRF1Q92994 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms