Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
NEO1Q92859 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEO1Q92859 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms