Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1AQ92747 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms