Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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