Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms