Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
DNAAF4Q8WXU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms