Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms