Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms