Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGDCC4Q8TDY8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms