Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms