Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms