Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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