Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms