Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD1Q8NA66 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms