Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PROM2Q8N271 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PROM2Q8N271 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms