Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms