Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms