Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC84Q86UT8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC84Q86UT8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms