Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms