Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms