Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms