Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMP1BQ7LBR1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMP1BQ7LBR1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms