Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP31Q70CQ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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