Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEND4Q6ZU67 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms