Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFAP47Q6ZTR5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms