Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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