Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP26C1Q6V0L0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP26C1Q6V0L0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP26C1Q6V0L0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms