Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms