Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms