Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms