Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms