Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWSAP1Q6NVH7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms