Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF6Q6KF10 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms