Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms