Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHSL1Q5SYE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms