Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4R3BQ5MIZ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms