Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ISXQ2M1V0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ISXQ2M1V0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms